五、成本费用构成和管理重点不同
这里指的成本费用是损益表中制造成本、销售费用、管理费用、财务费用之和，后三项费用亦称期间费用。在产销比正常的情况下，传统工业企业的成本费用的构成是制造成本高、期间费用低。因此，管理重点是制造成本，管理当局更注重对制造成本的控制。成本核算是否准确，成本考核指标是否落实，成本管理是否有效，成本降低机制是否形成，皆由制造成本管理状况所决定。高新技术企业的成本费用构成则相反，通常是制造成本低、期间费用高。期间费用高的原因是研发费用和销售费用高。因此，管理的重心要转移，转移到研发环节和技术服务环节。研发费用与销售费用使用的合理性，往往决定着高新技术企业的整体竞争实力。其产品成本在相当大的程度上是由设计所决定的，而其产品的销售状况如何又在相当大的程度上取决于技术服务。
六、成本费用控制方式不同
传统工业企业对成本的控制主要采用标准成本系统、目标成本和费用预算管理（包括零基预算与弹性预算）。尽管其控制范围有弹性，控制过程中也有许多不确定的因素，但是总能够通过对成本形成原因的分析和对成本费用发生规律的掌握来不断地促使其标准。目标和预算符合实际，以此来引导企业健康发展。高新技术企业对成本的控制不能简单地搬用上述做法。虽然标准成本、目标成本和费用预算等形式依然可以利用，但实际上由于其控制过程中的不确定因素更多，所以对成本动因的分析和对成本费用发生规律的掌握更为困难。在传统工业企业，尤其是经营稳定的大型工业企业，所耗费的资金与产生的回报之间，能够建立人们容易把握的函数关系。而在高新技术企业，这样的函数关系则不容易建立。因此，高新技术企业时成本费用的控制，宜更多地通过人们的行为来实施，而不是通过改善设备运行状态和建立严格的管理制度来实施，即应实行的是积极控制——鼓励多做工作多花钱，把该花的钱花足，把不该花的钱限制住。该花的钱是积极费用，不该花的钱是消极费用。积极费用越高，越能增强企业的竞争力。积极费用当然也包括实验、试制失败的费用，但对盲目实验与试制等所导致的消极费用，则要严格加以限制。
七、成本分析的主要方法不同
传统工业企业成本分析的主要方法是对比分析和差异原因分析，而高新技术企业成本分析应该重视的是价值工程分析、相关分析和预警分析。价值工程分析是利用产品成本结构与产品功能结构的比值关系来寻找降低成本、提高成本效能比率的途径，从而改进产品或工艺设计的有效方法。相关分析是利用成本或费用指标与其他经济指标之间的联系，来分析成本费用指标对其他经济指标的影响，以期通过增减成本或费用，来改善该项经济指标的状态。预警分析是通过对控制指标设且预警线（红线）来进行的。预警分为绝对预警和相对预警。绝对预警的红线就是由盈亏临界点所决定的成本费用开支水平。相对预警的红线有两种，一种是纵比红线，一种是横比红线。纵比红线可以以本企业成本费用指标的历史水平为标准设置，横比红线则要以竞争对手水平或行业水平为标准设置。
