危害分析与关键控制点（HACCP）是控制饮用纯净水中危害因素最有效的方法。
要生产合格的饮用水，必须建立一系列切实可行的制度，找出关键控制点，进行重点监控。首先对原水预处理的CCP（关键控制点）分析和控制。原水预处理的目标是去除原水中有机沉淀物、大颗粒杂质、一部分微生物及有毒有害气体；原水带菌不稳定和沙滤器压力下降过大，都可导致产品卫生指标不合格，如原水菌落数过高时，应对原水进行杀菌，对蓄水池进行清理消毒，从业人员应严格执行操作规程，定期清理设备，做好监测和记录。二是超滤的CCP分析和控制。超滤可除去水中大部分微生物，当超滤膜在使用一段时间后，微生物密度将会升高，如果超滤膜出现渗漏，将对产品造成污染，要注意定期更换，定期清洗，设置合理的膜反洗及消毒工艺。三是臭氧杀菌的CCP分析和控制。在正常条件下，合理地掌握臭氧操作四个因素（流量、接触面积、流速、时间），即可以达到灭菌目的，应根据流量、流速随时调整臭氧加入量。四是容器、桶盖的消毒。要科学、合理使用消毒剂，严格遵守消毒时间，如果消毒质量得不到保证，水质再好也生产不出合格的饮用水。
因此，纯净水生产企业要在日常工作中严格把关，时刻注意各重点环节的监控，保证桶装水的卫生质量，给消费者提供安全卫生的饮用水。
