A.依照法律、行政法规的规定应当设置但未设置账簿的

B.依照法律、行政法规的规定可以不设置账簿的

C.擅自销毁账簿或者拒不提供纳税资料的

D.依照法律、行政法规规定科学合理设置账簿，有健全的财务管理制度的

E.照章纳税的

正确答案：A、B、C

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答案解析:纳税人有下列情形之一的，税务机关有权核定其应纳税额：
（1）依照法律、行政法规的规定可以不设置账簿的。
（2）依照法律行政法规的规定应当设置但未设置账簿的。
（3）擅自销毁账簿或者拒不提供纳税资料的。
（4）虽设置账簿，但账目混乱或者成本资料、收入凭证、费用凭证残缺不全，难以查账的。（5）发生纳税义务，未按照规定的期限办理纳税申报，经税务机关责令限期申报，逾期仍不申报的。
（6）纳税人申报的计税依据明显偏低，又无正当理由的。

相关知识：第一节 税务基础管理