中国居民企业A（所得税税率为25%）持有甲国B公司40%股权，甲国的所得税税率为10%

参考答案：（1）A公司来自B公司的股息所得，符合间接抵免条件，因为A公司对B公司的直接持股比例超过20%
（2）A公司直接缴纳的来自B公司股息的预提所得税为50万元。
B公司所纳税额属于由A公司负担的部分=（本层企业就利润和投资收益所实际缴纳的税额+符合规定的由本层企业间接负担的税额）×本层企业向一家上一层企业分配的股息（红利）÷本层企业所得税后利润额=400×1000÷3600=111.11（万元）
A公司来自B公司的所得直接缴纳和间接负担的税额=50+111.11=161.11（万元）
（3）A公司来自B公司股息所得调整后的应纳税所得额=境外股息、红利税后净所得+该项所得直接缴纳和间接负担的税额之和-计算企业应纳税所得总额时已按税法规定扣除的有关成本费用中与境外所得有关的部分=950+161.11-20=1091.11（万元）
（4）抵免限额=109.11×25%=272.78（万元）
直接缴纳和间接负担的税额为161.11万元，按照161.11万元抵免
需补缴的税款=272.78-161.11=111.67（万元）

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答案解析:

相关知识：第三节 境外所得税收管理