A.经受理后的专利申请按照规定缴纳申请费的，自动进入初审阶段

B.初审后发明专利申请首先要进行保密审查，需要保密的，按保密程序处理

C.在初审时要对申请是否存在明显缺陷进行审查

D.若是外国申请人还要进行资格审查及申请手续审查

正确答案：B

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答案解析:本题考查发明专利申请初步审查与实质审查。
初审后发明专利申请首先要进行保密审查，需要保密的，按保密程序处理。
B说法错误，ACD说法均为正确。
故本题正确答案为B。

相关知识：第二章、专利申请