随着支付宝余额宝的普及，越来越多的人开始使用它来存储闲置资金。然而，有些人会担心存入100万的资金是否安全。

首先，我们需要了解余额宝的运作原理。余额宝是由天弘基金管理有限公司管理的一种货币市场基金，其投资标的主要是短期国债、政策性金融债券、大型商业银行的定期存款等低风险金融产品。因此，余额宝本身的风险是相对较低的。

其次，余额宝资金的安全性也有保障。根据有关规定，余额宝的资金是由银行进行存管，即余额宝中的资金并不会直接由支付宝所有，而是由银行进行管理和监督。同时，余额宝的资金也都有银行保险进行保障，每个账户最高可以获得50万元的保险赔偿。因此，即使发生了不可预见的风险，用户的本金和收益也能得到保障。

最后，作为用户，我们还需要注意一些安全问题。例如，保护好自己的支付宝账户、密码等信息，不轻易泄露个人信息和银行卡信息。同时，我们也需要注意余额宝的收益率和风险评级等信息，以便合理投资和管理资金。

综上所述，支付宝余额宝存100万是相对安全的。但是，我们还是需要注意账户和资金的安全，以及合理管理投资资金。