近年来，随着城市化进程的加快，农村地区的房屋建设也得到了很大的发展。在这个过程中，一些农民在自己的房屋顶部搭建了彩钢棚，用于存放农具等物品。然而，很多人却不知道这样的行为是否违法，以及该如何处理。

首先，需要明确的是，农村房顶彩钢棚并不是全部都属于违建。按照相关规定，若彩钢棚的面积在20平方米以下，且建设符合规划、环保等要求，则属于合法建设。但若超过了20平方米，或者建设没有经过规划、环保等部门的批准，则属于违建。

那么，对于违建的农村房顶彩钢棚，该如何处理呢？首先，相关部门会对其进行查处，并要求拆除。农民可以在规定期限内自行拆除，或委托专业拆除公司进行拆除。如果拒不拆除，则可能会面临罚款等后果。

但是，对于一些特殊情况，相关部门也会进行适当的处理。比如，一些老旧建筑需要进行改造，但是由于经济原因，无法进行大规模的改造，此时可以允许保留彩钢棚。同时，也可以考虑为彩钢棚进行规范化管理，加强环保措施等。

总之，农村房顶彩钢棚的合法性需要根据具体情况进行判断。对于违建的彩钢棚，需要及时进行处理，但也需要考虑到特殊情况。希望农民们能够根据相关规定进行建设，避免违法行为的发生。