根据相关法律法规规定，驾校学员档案应当保留至少5年以上。这是因为驾校学员档案中包含着学员的个人信息、学习记录等重要信息，需要在一定时期内保留以备查证。

在驾校学员档案中，通常包括学员的个人基本信息、身份证明、健康状况、学车记录等内容。这些信息对于驾校及相关管理部门来说都有着重要的意义。例如，学员的健康状况信息可以帮助驾校在学员学车时对其进行合理的安排，防止因健康原因导致事故的发生；学车记录可以帮助驾校对学员的学习情况进行评估，进而为学员提供更好的服务。

除此之外，驾校学员档案还有着重要的法律意义。在发生交通事故等情况时，学员驾照的颁发及吊销都需要依据学员档案中的相关信息进行判断。因此，驾校学员档案的保留期限必须要足够长，以保证学员权益的合法性。

综上所述，驾校学员档案的保留期限应当不少于5年以上。驾校及相关管理部门应当严格遵守相关法律法规规定，妥善保管学员档案，保障学员权益，确保交通安全。