手动挡车辆在遇到堵车时，需要做出一些特别的操作，才能更好地应对行车状况，保证安全和顺畅。

首先，当车辆行驶到堵车路段时，需要减速慢行，保持一定的安全距离，避免突然刹车造成追尾事故。此时，可以将挡位放到二挡或者三挡，用离合器来控制车速，以保持匀速行驶。

其次，当车辆行驶到缓慢停止的路段时，需要及时减速停车，并将挡位放到空挡状态，用手刹来固定车辆位置。此时，需要保持警觉，随时观察前方车辆的变化，以便及时应对。

最后，在车辆缓慢行驶时，如果前面的车辆突然加速或者离开了堵车路段，需要及时换挡并加速，以保证跟上前面车辆的速度，避免造成交通阻塞。

总之，手动挡车辆在遇到堵车时，需要灵活应对，根据具体情况来调整挡位和车速，以保证行车安全和顺畅。