多数生物碱为结晶形固体,少数为非结晶形粉末;具有固定的熔点,有的具有双熔点,个别的仅具有分解点;少数小分子的生物碱,如烟碱、毒芹碱、槟榔碱等为液体,其分子结构中不含氧原子或氧原子结合为酯键。少数液体状态和小分子的固体生物碱具有挥发性,可用水蒸气蒸馏。个别生物碱还具有升华性,如咖啡因。
生物碱多具苦味,少数呈辛辣味或具有其他味道,如甜菜碱具有甜味。
绝大多数生物碱为无色或白色,仅少数分子中具有较长共轭体系和助色团者有一定的颜色,如小檗碱、蛇根碱呈黄色,药根碱、小檗红碱呈红色等。有的生物碱在可见光下无色,而在紫外光下显荧光,如利血平。
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