A.商标注册申请手续不齐备的，不予受理

B.申请人要求核定的商品填写不规范的，不予受理

C.申请手续基本齐备但需要补正的，通知申请人在15日内补正

D.申请人在补正期限内未按照要求补正的，不予受理

E.商标局不予受理的，应书面通知申请人

正确答案：A、D、E

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答案解析:商标注册申请手续不齐备、未按照规定填写申请文件或者未缴纳费用的，商标局不予受理。商标注册申请手续基本齐备或者申请文件基本符合规定，但是需要补正的，商标局通知申请人予以补正，限其自收到通知之日起30天内，按照指定内容补正并交回商标局。在规定期限内补正并交回商标局的，保留申请日期。期满未补正的或者不按照要求进行补正的，商标局不予受理并书面通知申请人。
B选项错误：填写不规范但是及基本符合规定，需要补正的，通知申请人予以补正，而不是一概不予受理

相关知识：第二节 商标的注册