喀什大学始建于1962年，前身为喀什师范专科学校，从建校到1978年底的16年间，学校是自治区5所高等院校(新疆大学、新疆工学院、八一农学院、新疆医学院、新疆喀什师范专科学校)中唯一的一所高等师范院校，在新疆特别是南疆基础教育、社会稳定和经济发展方面发挥了不可替代的重要作用。1978年学校升格为本科院校，更名为喀什师范学院。2003年获得硕士学位授权单位资格，开始承担硕士研究生培养任务。2007年在教育部本科教学水平评估中取得了优秀成绩。2012年，被列为中西部高校基础能力建设工程高校。2015年4月，更名为喀什大学。2016年6月，被确定为全国100所转型发展试点高校之一。1994年、2009年，学校先后两次被国务院授予“全国民族团结进步模范集体”光荣称号;2014年，学校中国语系被国务院授予“全国民族团结进步模范集体”光荣称号。