研究所的组建基础是中国科学院长春综合研究所土木建筑研究室。研究所于1952年底在黑龙江省哈尔滨市开始筹建，1954年11月正式成立，定名为中国科学院土木建筑研究所;1963年5月研究所更名为中国科学院工程力学研究所，1970年7月起研究所接受国家地震局和中国科学院双重领导，1984年4月研究所正式划归国家地震局并更名为国家地震局工程力学研究所，1998年4月研究所随着国家地震局更名为中国地震局而更名为中国地震局工程力学研究所。