河北医科大学初名北洋医学堂，1894年由直隶总督兼北洋大臣李鸿章于天津创办，是中国近代第一所官办西医院校。辛亥革命后，1912年1月19日国民政府教育部颁发《普通教育暂行办法通令》，北洋医学堂改为北洋医学校。1912年10月22日，国民政府教育部又颁发《专门学校令》“十六”号令，据此1913年(民国二年)9月北洋医学校更名为直隶公立医学专门学校，并开始招收本科生。1915年学校迁至保定。1937年7月7日抗日战争全面爆发，学校被迫停办。1946年1月复校招生。1949年4月更名为河北医学院。1958年学校由保定迁至石家庄。1995年，原河北医学院、河北中医学院、石家庄医学高等专科学校三校合并，改称河北医科大学。2013年河北中医学院恢复独立建制。2016年，教育部、国家卫生计生委、河北省人民政府正式签署共建河北医科大学协议。