中国科学院遗传与发育生物学研究所最早成立于1959年，在2001-2003年经由原中国科学院遗传研究所、发育生物学研究所及石家庄农业现代化研究所整合而组成现在的研究所。目前，共有58个创新研究组，现任所长薛勇彪博士。现有职工532人，其中科技人员342人。中国科学院院士2人，研究员58人，国家杰出青年基金获得者24人，"百人计划与引进国外杰出青年人才"36人。获得3个国家基金委"创新科研群体"和2个中科院"创新团队国际合作伙伴计划"的资助。设有遗传学、发育生物学、细胞生物学、生态学和生物信息学专业硕士、博士学位培养点及博士后流动站。现有博士生导师58人。在读研究生531人（博士生350人）。在站博士后20人。
　　遗传发育所瞄准农业可持续发展和人口健康的国家重大战略需求，针对重要农艺性状分子机理、细胞分化与器官发育、生物分子网络、动植物品种设计以及农业资源高效利用等领域的关键科学问题，开展原始创新和集成创新研究，提出和发展具有重大影响的科学理论和概念；建立和完善动植物品种分子设计和培育的方法、重要遗传疾病研发以及农业资源高效利用的技术体系。
　　遗传发育所下设5个研究中心(植物基因研究中心、分子农业生物学研究中心、发育生物学研究中心、分子系统生物学研究中心和农业资源研究中心)和研究资源中心以及河北栾城农田生态系统国家野外观测试验站等网络台站支撑系统；拥有植物基因组学国家重点实验室、植物细胞与染色体工程国家重点实验室、中国科学院分子发育生物学重点实验室和河北省节水农业重点实验室；是国家植物基因研究中心（北京）的依托单位。