三系杂交水稻是一种利用基因组学的方法，通过对水稻进行基因编辑和基因组重组，实现杂交育种的新型方法。它的原理是利用三个不同的亲本，包括两个不育亲本和一个可育亲本，进行交配和杂交。

具体来说，第一个不育亲本（AA）被编辑成只有雄性生殖器官，不能自我授粉；第二个不育亲本（BB）则被编辑成只有雌性生殖器官，也无法自我授粉。而可育亲本（CC）则被编辑成可以自我授粉并产生高质量的种子。

在杂交过程中，雄性不育亲本（AA）作为花粉亲本，与雌性不育亲本（BB）进行杂交，产生的F1代（AB）不仅可以自我授粉，还可以与可育亲本（CC）进行杂交。这样，产生的F2代就是具有三个基因组的三系杂交水稻，其中包括父本的AA、BB基因组和母本的CC基因组。这种三系杂交水稻的种子，虽然不具备自我授粉能力，但其杂交后代可以获得多种优良的性状，如高产、高品质、抗逆性等，成为了现代水稻育种的重要手段之一。

总的来说，三系杂交水稻利用基因组学技术，突破了传统杂交固有的限制，能够实现不同亲本间的杂交，加速水稻育种进程，提高水稻的产量和质量，对于缓解全球粮食安全问题具有重要意义。