入职时填写的档案所在地通常是人力资源部门或者公司的管理部门。这些部门负责管理公司的员工档案，并确保这些档案的安全和保密性。

员工的档案包括个人信息、合同、薪资、培训记录、绩效评估、福利待遇等重要信息。这些档案对于公司的管理非常重要，因为它们可以用来评估员工的工作表现和需求，以及为员工提供相应的培训和福利待遇。

因此，公司必须确保这些档案得到妥善管理和保护。在人力资源或管理部门，只有授权人员可以访问这些档案，并且他们必须严格遵守公司的保密规定。

此外，公司还必须遵守相关的法律法规，例如保护个人信息的法律。这意味着公司必须采取必要的措施来保护员工档案的隐私和安全。

总之，入职时填写的档案所在地是公司的人力资源或管理部门，这些部门负责管理和保护员工的档案，以确保公司能够有效地管理员工并满足其需求。