科目三是驾驶考试中非常重要的一个环节，需要考生进行技能操作和道路规则的综合考核。如果考生在科目三考试中成绩合格了，但是交管部门却没有通过，可能是以下几个原因：

首先，考生在科目三考试中虽然成绩合格了，但是在考试过程中存在违规或者失误。比如说，考生在倒车入库的时候没有按照规定的路线行驶，或者在考试中出现了碰撞等事故。这些情况都会被交管部门记录在档案中，从而导致考试不通过。

其次，考生在科目三考试中虽然成绩合格了，但是在道路上的实际驾驶能力还存在问题。科目三考试只是对考生驾驶技能的简单测试，真正的驾驶能力需要在道路上不断练习和积累。如果考生在科目三考试中表现出来的驾驶能力与实际驾驶能力不符合，交管部门就有权利不予通过考试。

最后，考生在科目三考试中虽然成绩合格了，但是存在其他不符合规定的情况。比如说，考生在考试中使用了非法证件或者作弊行为，这些都是交管部门不会容忍的行为，会直接导致考试不通过。

综上所述，科目三考试虽然只是驾驶考试的一个环节，但是对于考生来说非常重要。如果考生想要顺利通过科目三考试，不仅需要在技能操作和道路规则上做好准备，还要遵守考试规定，不出现违规或者失误的情况。只有这样，才能顺利通过科目三考试，拿到驾驶证。