北京市新农合门诊是一项重要的医疗保障政策，可以帮助农村居民解决看病难、看病贵的问题。根据最新的政策规定，北京市新农合门诊一年可以报销的金额达到了5000元。

这个5000元的报销额度是针对每个参保人员的，也就是说，每个参保人员一年内可以报销的医疗费用最高达到5000元。这个报销额度是按照实际医疗费用的50%进行报销的，也就是说，如果一年内参保人员的实际医疗费用是10000元，那么他可以获得5000元的报销。

需要注意的是，北京市新农合门诊报销范围是有限制的，只包括基本医疗保险范围内的医疗费用，例如门诊诊疗、住院费用、药品费用等。而一些高端检查、特殊治疗、美容整形等费用则不在报销范围内。

此外，参保人员需要按照规定的程序进行报销申请，需要提供相关的医疗发票和报销证明材料，才能获得报销资格。

总之，北京市新农合门诊为农村居民提供了重要的医疗保障，一年可以报销的金额为5000元，帮助他们解决看病难、看病贵的问题。